Nowatorski prototypowy wariant białka prionowego, który kojarzy się z ekspozycją Kuru cd

Genotypowanie kodonów 129 i 127 przeprowadzono w dodatkowych osobach z prowincji Eastern Highlands, w tym w grupach językowych, które nie miały ekspozycji lub małej ekspozycji na kuru, oraz w osobach z bardziej odległych regionów Papui Nowej Gwinei, w tym regionów przybrzeżnych i sąsiednich wysp. Najnowszy wspólny przodek polimorfizmu G127V w tej populacji został oszacowany za pomocą programu ESTIAGE20 lub za pomocą wzoru Risch i wsp., 21, skorygowanego przez Colombo.22 Struktura populacji została oceniona za pomocą EIGENSTRAT oprogramowanie23 lub metoda kontroli genomowej.24 Dodatkowe szczegóły dotyczące metod zawarte są w Dodatku uzupełniającym, dostępnym wraz z pełnym tekstem tego artykułu na stronie.
Wyniki
Indeks próby i ekspozycji
Wcześniej mówiliśmy, że istniała niespójność Hardy ego-Weinberga genotypu kodonu 129 w małej grupie starszych kobiet z grupy Fore, które uczestniczyły w wielu uczniach w grobowcach.12 Teraz rozszerzyliśmy te dane o 10 ostatnio otrzymanych próbek i 142 zarchiwizowanych próbek od pacjentów z kuru, wyniki prawie zakończonego badania starszych osób, które przeżyły uczty pogrzebowe (557 osób z regionu kuru, urodzonych przed 1960 r., w tym 30 kobiet, których dane zostały wcześniej zgłoszone), oraz wyniki szerokiego pobierania próbek zdrowych aktualnych populacji w narażonych i nienaświetlone obszary prowincji Eastern Highlands (2053 osoby) i bardziej odległe regiony Papui Nowej Gwinei (313). Rozlałyśmy te próbki zgodnie z krytycznymi uwarunkowaniami narażenia na kuru na podstawie uczestnictwa w ucztach pogrzebowych: płeć, data urodzenia i wieś zamieszkania.
Wykreślając kontury indeksów ekspozycji (patrz rozdział Metody ), zdefiniowaliśmy trzy strefy w regionie kuru: wysoka ekspozycja (indeks ekspozycji> 200), średni poziom ekspozycji (indeks ekspozycji> 30 do 200) i niski poziom ekspozycji (indeks ekspozycji . 30) oraz dwie dodatkowe strefy nieeksponowane: obszary prowincji Eastern Highlands, które znajdują się w pobliżu regionu kuru, ale nie mają ustnej historii kuru i odległych regionów Papui Nowej Gwinei (patrz rozdział Metody ).
PRNP 127V i dystrybucja geograficzna 129V
Oprócz tych ważnych rozszerzeń naszych wcześniejszych wyników w odniesieniu do genotypu kodonu 129, obecnie donosimy o nowatorskiej zmianie kodowania PRNP, G127V (c.380G . T, CCDS13080.1), która znajduje się w wysoce konserwowanym i uporządkowanym regionie PrP. Zbadaliśmy, czy ten wariant jest polimorfizmem neutralnym, nowatorską patogenną mutacją powodującą wrodzoną chorobę prionową (która mogła stanowić zakaźne źródło epidemii kuru), czy polimorfizmem wywołującym oporność na chorobę prionową, która mogła zostać wybrana w wyniku epidemii kuru.
Rysunek 1. Rycina 1. Cline w częstości alleli PRNP 129 V w Papui Nowej Gwinei. Rosnąca liczba klatek w centrach częstotliwości 129V w regionie kuru. Łącznie 282 próbki od młodych osób z regionu kuru zostały dopasowane przez wioskę do starszych kobiet ze stref średnich i stref wysokiego narażenia (zielone) (patrz Dodatek dodatkowy). 546 osób w strefach niskoemisyjnych obejmowało grupy językowe, które graniczą z regionem kuru, wśród których znajdują się przynajmniej niektóre udokumentowane przypadki kuru: Gimi (87 osób), Yate (157), Keiagana (221), Kanite (35) i Awa (46) (niebieski i szary)
[przypisy: poradnia dietetyczna wrocław, unident, rurka tracheostomijna metalowa ]

Powiązane tematy z artykułem: poradnia dietetyczna wrocław rurka tracheostomijna metalowa unident